48 variantes coronavirus se han identificado en Campania desde el comienzo de la pandemia.
Esto es lo que surge de un estudio sobre el monitoreo de las cepas más agresivas que trae la firma de Anna Maria Rachiglio, farmacología del Instituto Pascale de Nápoles, publicado en la revista científica “Journal of Translation Medicine”.
“El estudio – explica Rachiglio – por primera vez describió el tipo de variantes de Sars-Cov-2 en Campania revelando la presencia de una notable heterogeneidad de las cepas virales desde la primera fase de la pandemia. Los datos están relacionados con la secuenciación del genoma del virus obtenido a partir de swabs moleculares, recogidos durante el período comprendido entre marzo y abril de 2020, de individuos residentes principalmente entre las provincias de Nápoles y Caserta".
para pascale el protocolo de rápida secuencia del virus
Para garantizar una alta eficiencia del sistema de monitoreo de variantes y el uso de equipos altamente sofisticados, en los laboratorios Mercogliano del Pascale, dirigidos por Nicola Normanno, se ha desarrollado un protocolo de secuenciación rápida del virus, permitiendo una secuencia viral completa dentro de las 24 horas del buffer molecular. La nueva tecnología ha sido posible gracias al uso de una máquina de secuenciación de alta automatización de próxima generación, la Genexus, de la que Pascale fue uno de los primeros centros en Europa para equiparse.
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Genexus es un sistema de secuenciación de próxima generación totalmente automatizado y de alta productividad que puede secuenciar hasta 32 muestras en 24 horas. “Usando un sistema de alto rendimiento – seguir leyendo – de hecho nos permitió ser capaces de acelerar significativamente la secuencia en comparación con los procedimientos estándar y obtener el genoma viral completo de muestras que tenían un número muy bajo de copias del virus.”. Desde la comparación entre las secuencias obtenidas y el genoma de referencia Wuhan-Hu-1, se encontró la presencia de 48 variantes de nucleótidos, principalmente observados en las regiones Orf1ab y Spike, de las cuales 12 nunca fueron detectados antes. En particular, la mayoría de las muestras de la zona de Nápoles pertenecen a 7 grupos diferentes, datos consistentes con lo que se espera pueden ocurrir en áreas con alta densidad de vivienda.
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Los resultados obtenidos son el resultado de la colaboración entre Pascale, la Universidad Federico II y el Instituto Superior de Salud, gracias a la financiación de la Región. Al proyecto fuertemente querido por el director científico del Instituto de tumores de Nápoles, Gerardo Botti, han participado, en diversas razones, Ernesta Cavalcanti, Luca De Sabato, Cristin Roma, Michele Cennamo, Mariano Fiorenza, Daniela Terracciano, Raffaella Pasquale, Francesca Bergantino, Gabriele Vaccari, Giuseppe Portella, Nicola Normanno. Mientras tanto, el monitoreo de las variantes en Pascale, que coordina un estudio para la caracterización de las cepas virales debido a la infección en pacientes de cáncer y trabajadores de salud. “Investigación – dice el gerente general del polo oncológico partenopeo Attilio Bianchi – ahora ha superado enfoques divisivos, para asumir un significado sistémico más y más preciso. Covid trabajó como catalizador, enfatizando de manera decisiva y definitiva la osmosis entre el conocimiento. Felicitaciones al grupo de trabajo que ha producido esta investigación y a todos aquellos que cada día nos ayudan a buscar nuevos caminos”.
